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Important informations

Laboratoire

Groupe de biopsie liquide LUMIÈRE

Le groupe de biopsie liquide LUMIÈRE a été créé en 2023 par un groupe de cliniciens-chercheurs et de scientifiques qui étaient collectivement intéressés à mettre en œuvre des tests de biopsie liquide dans le cadre des soins contre le cancer et de la recherche sur le cancer. Le consortium, dirigé par la Dre April Rose, est basé à l’Hôpital général juif en collaboration avec les docteurs Adriana Aguilar, Mark Basik, Gerald Batist, Melica N. Brodeur, Nathalie Johnson, Andreas Papadakis et Alan Spatz. Le Centre de recherche translationnelle sur le cancer de McGill (CRTCM) et OptiLab sont des entités collaboratives centrales de LUMIÈRE.

La mission de LUMIÈRE est de développer une expertise et d’être un centre d’excellence pour les tests de biopsie liquide dans la recherche sur le cancer et les soins contre le cancer. Cela couvre un large éventail d’applications et d’indications de biopsie liquide, notamment le profilage moléculaire diagnostique initial, la surveillance de la maladie résiduelle minimale, le profilage moléculaire en cas de récidive et l’optimisation des thérapies personnalisées.

Le travail accompli au sein de notre consortium ne serait pas possible sans le soutien de nos bailleurs de fonds, notamment AstraZeneca, Pfizer, Teamsters Canada, Illumina, le réseau Marathon of Hope Cancer Centres Network et le Centre de recherche translationnelle sur le cancer de l’Université McGill.

Équipe

LUMIÈRE Liquid Biopsy Group

From left to right: Chantal Autexier, Jian Qin, Adrian Young, Patrick Lambert-Lanteigne, Linda Pallotto, Alexandre Garus.

Recherche

LUMIÈRE a plusieurs projets en cours dont :

Projet 1 – Mise en place d’une plateforme de biopsie liquide pour la détection de la maladie résiduelle minimale dans les tumeurs solides (chercheur principal : Dr Mark Basik, cochercheur: Dre Adriana Aguilar)

Notre équipe développe une plateforme de biopsie liquide de pointe qui permet de détecter la maladie résiduelle minimale grâce à l’analyse de l’ADN tumoral circulant (ctDNA). En utilisant le séquençage de nouvelle génération du tissu tumoral et des tests PCR numérique en gouttelettes (ddPCR) hautement sensibles adaptés à la tumeur de chaque patient, nous pouvons suivre les mutations spécifiques à la tumeur dans les échantillons sanguins au fil du temps. Cette approche nous permet de surveiller la réponse au traitement, d’identifier les premiers signes de récidive et d’améliorer les décisions thérapeutiques personnalisées en aidant à orienter le traitement. Nos recherches se concentrent particulièrement sur le cancer du sein, où nous avons démontré la valeur pronostique et prédictive de l’ADNct chez les patientes atteintes d’un cancer du sein triple négatif dans le cadre de deux essais cliniques indépendants (Q-CROC-03 et TRICIA). Nous étendons actuellement ces travaux aux patientes atteintes d’un cancer du sein Her2+ et ER+, ainsi qu’aux cancers de l’ovaire, de la vessie et colorectal.

Projet 2 – MUPPET : Développement d’une plateforme de médecine de précision pour le cancer de la prostate métastatique (chercheuse principale : Dre April Rose)

Le cancer de la prostate métastatique se caractérise par un large éventail d’altérations ou de mutations génétiques pouvant faire l’objet d’un traitement thérapeutique. Notre pratique standard actuelle consiste à déterminer si ces mutations sont présentes dans les tissus tumoraux archivés. Mais en testant uniquement les tissus archivés, nous risquons de passer à côté de certaines de ces altérations potentiellement exploitables. L’objectif du projet MUPPET est d’évaluer si la biopsie liquide (test ctDNA) améliore la précision diagnostique pour détecter ces altérations génétiques chez les patients atteints d’un cancer de la prostate métastatique. Le projet permettra également de développer des modèles précliniques de cancer de la prostate résistant au traitement et de tester de nouveaux traitements ciblés conçus pour surmonter cette résistance.

Projet 3 – Biopsies liquides pour optimiser la médecine de précision dans le cancer colorectal métastatique (chercheur principal : Dr Gerald Batist)

Ce projet vise à établir et valider l’utilisation du test d’ADN circulant acellulaire (ADNcf) comme approche minimalement invasive pour guider les décisions de traitement dans le cancer colorectal métastatique (CCRm). En comparant l’ADNcf et le profilage moléculaire basé sur les tissus, l’étude évaluera la concordance des biomarqueurs, le temps de traitement et l’impact clinique. Il cherche également à intégrer le test ADNcf dans la pratique courante à travers le Québec, en s’appuyant sur des preuves réelles (RWE) pour soutenir son adoption en tant que test standard remboursé.

Projet 4 – Biopsies liquides pour les lymphomes réfractaires (chercheuse principale : Dre Nathalie Johnson)

Le lymphome, un cancer du système immunitaire, présente un défi thérapeutique complexe. La chimiothérapie, la norme actuelle, permet de guérir environ la moitié des patients. Pour les patients atteints d’un lymphome agressif récidivant, des immunothérapies telles que les cellules T à récepteurs antigéniques chimériques (CART) sont efficaces chez certains patients, mais l’augmentation de la charge tumorale est associée à des taux de réponse plus faibles et à des toxicités accrues. Notre projet utilise un panel de gènes personnalisés pour détecter l’ADN tumoral circulant résiduel (ADNtc) dans le sang afin de détecter une résistance précoce au traitement, avant que les patients ne présentent des symptômes de rechute clinique manifeste. En analysant des échantillons de plasma provenant de patients atteints de lymphomes agressifs traités par chimiothérapie et CAR-T de deuxième ligne, nous visons à personnaliser le calendrier des traitements. Cette approche personnalisée pourrait améliorer considérablement l’efficacité et réduire la toxicité des immunothérapies en intervenant plus tôt, lorsque la charge tumorale est faible, offrant de meilleurs soins aux patients et réduisant potentiellement les coûts des soins de santé.

Projet 5 – OVATION : Analyse des variants du cancer de l’ovaire pour une oncologie individualisée ciblée
 (chercheuse principale : Dre Melica Brodeur)

Ce projet explore si le test ctDNA peut remplacer les biopsies tissulaires invasives pour identifier les patientes atteintes d’un cancer de l’ovaire qui bénéficieraient d’une thérapie d’entretien par inhibiteur de PARP ou d’une autre thérapie ciblée. Le résultat attendu est une approche diagnostique plus rapide et moins invasive pour améliorer l’accès à une thérapie ciblée et les résultats pour les patients. De plus, ce projet vise à surveiller les niveaux d’ADNct pendant le traitement par inhibiteur de PARP pour comprendre la cinétique de l’ADNct au fil du temps et comment il est corrélé aux résultats. Le résultat escompté est une durée de thérapie personnalisée, une réduction de la toxicité liée au traitement. Pour plus d’informations, veuillez contacter le Laboratoire de recherche en oncologie gynécologique.

Projet 6 – MINGLE : Intégration multimodale de l’IA utilisant l’imagerie pathologique par lame entière et la génomique pour améliorer le traitement du cancer (chercheur principal : Dr Alan Spatz)

Le projet MINGLE vise à transformer le diagnostic et le traitement du cancer en intégrant l’intelligence artificielle (IA), l’imagerie par lame entière (WSI) et la génomique basée sur l’ADNc dans une plateforme multimodale unifiée. En utilisant le cancer du sein comme modèle, il cherche à valider des classificateurs de pathologies alimentés par l’IA qui prédisent des mutations génomiques exploitables, améliorent le pronostic et guident le choix du traitement grâce à l’intégration de données réelles (RW).

Titre

Contemporary research has uncovered a role for environmental copper in the development and progression of neurodegenerative diseases such as Alzheimer’s and Parkinson’s disease. Previous research implicated non-ceruloplasmin bound copper in the aggravation of neurodegenerative phenotypes. Our research explores the role of copper in ALS progression through monitoring of copper biomarkers and analyses of copper metabolism gene expression.

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Team

Patrick Lambert-Lanteigne

Patrick Lambert-Lanteigne

Research Assistant

I obtained my BSc in pharmacology at University of Sherbrooke and graduated from University of Montreal with a MSc in pharmaceutical sciences in Prof. Huy Ong’s laboratory developing a ligand screening method for the CD36 receptor using SPR (surface plasmon resonance) biosensor. I then worked for Prof. Arnim Pause at McGill University trying to elucidate the interaction pattern between the folliculin protein with its binding partner AMPK. I then joined Prof. Chantal Autexier’s laboratory as a research assistant where I work in telomere biology, manage the lab and mentor undergraduate and graduate students. I helped characterize the binding pocket of two telomerase domain/motifs, IFD and TEN, with its binding partner TPP1, and I now focus on the telomerase-independent alternative lengthening of telomere mechanism. 

Research Associates

Jian Qin

Jian Qin

Team Arsenic

I received a BSc in Molecular Biology & Genetics from McMaster University in 2017. I am currently studying how mutations of dyskerin, a telomerase-associated protein, affect its interaction with other proteins, subcellular localization, and telomerase RNA abundance.

Adrian Young

Adrian Young

Team Copper

I am a Belizean pursuing a PhD in Anatomy and Cell biology at McGill University in Montreal. I completed my BSc in Biochemistry and Cellular and Molecular Biology and my MSc in Biochemistry at Memorial University in Newfoundland Canada. My research interest involves increased understanding stem and cancer cell dynamics and redox biology to be applied to therapeutics for health span extension.

PhD Students

Alexandre Garus

Alexandre Garus

Team OPE

I come from Brazil, where I graduated in Biochemical Engineering at the Federal University of Paraná. I have more than four years of professional experience in manufacturing and quality assurance of reagents for molecular diagnostics. Now I’m interested in better understanding the role of the protein dyskerin and H/ACA ribonucleoprotein complexes in regulating telomere biology and cellular aging.

Linda Pallotto

Linda Pallotto

Team Arsenic

Linda completed her BSc in Biology at the University of Waterloo. During her undergraduate degree, she worked as a co-op student in the lab of Dr. Paul Mains where her project used C. elegans to describe gene variants that cause drug resistance in parasitic nematodes. After graduating, she worked for a year in the lab of Dr. Ryan Yuen at SickKids in Toronto investigating short tandem repeat expansions using Nanopore and Sanger sequencing. She is now pursuing her MSc in the Autexier lab and is interested in how a region of telomerase, known as the insertions in fingers domain (IFD), is involved in its localization and activity at the telomeres. When not in lab, Linda enjoys listening to music or watching movies while she knits.

LUMIÈRE 2

Madelyn Abraham

Team Lymphoma

Madelyn is a PhD student in the department of Experimental Medicine. She uses mouse modelling to study Diffuse Large B Cell Lymphoma. In particular, she has found that mutations in the transcription factor STAT6 are enriched at disease relapse, and I study how this contributes to remodeling of the tumour microenvironment.

LUMIÈRE 2

Rowa Bakadlag

Team Tungsten

Rowa is a PhD candidate in the department of Experimental Medicine. She completed her BSc in Microbiology and Immunology in Saudi Arabia, then completed two MScs in Genetics and Parasitology at McGill University. Her work investigates tungsten toxicity focusing on SLC2A2 as a transporter and the effects on mature B lymphocytes.

MSc Students

LUMIÈRE 2

Vincenza Caruana

Team Vaping

Vincenza is an MSc. Student in the Department of Pharmacology. She completed her BSc. in Pharmacology at McGill University. Her project aims to elucidate the role of e-cigarette use on the murine cardiopulmonary system. Specifically, she is focusing on metal deposition in the lungs, and the progression of atherosclerosis due to these exposures.

LUMIÈRE 2

Ayse Nazli Zengin

Team Arsenic

Nazli Zengin is an MSc. student in the Department of Pharmacology. She has a background in pharmacology and environment. Her work currently focuses on elucidating how sex and diet modulate arsenic toxicity and its immunological and cardiovascular consequences.

LUMIÈRE 2

Andrew Little

Team Arsenic

Andrew is an MSc. student in the Department of Pharmacology who graduated from the B.Sc. program in Biochemistry at McGill in 2021. He works on a proteomics project centred around Arsenic 3-Methyltransferase and the question about whether it serves an additional function.

LUMIÈRE 2

Raymond Tu

Team Tungsten

Raymond is an MSc. Student in the Department of Pharmacology who completed his BSc. in Environmental Health Sciences from the UNC Chapel Hill as a as a Morehead-Cain Scholar. He received the McCall MacBain Scholarship in 2021. His project studies the mechanism of tungsten on mTORC1, a major regulator of cell growth and proliferation.

LUMIÈRE 2

Nikola Kukolj

Team Arsenic

Nikola is an incoming MSc Student who completed his undergraduate degree in
Microbiology and Immunology at McGill University. He is currently working on an NSERC
summer project that assesses the functional characterization of macrophages exposed to arsenic using murine bone marrow-derived macrophages.

Undergraduate Students

LUMIÈRE 2

Roni Juran

Team Vaping

Roni is a second-year BSc student in Chemistry at McGill. As an undergraduate student, she works on various projects across the lab, but is currently focused elucidating the correlation between nonalcoholic fatty liver disease and vaping.

Nouvelles/étapes importantes

En 2025, le groupe LUMIERE a fait l’acquisition d’un séquenceur NovaSeq 6000 et tous les tests de contrôle qualité initiaux ont été effectués. L’étude MUPPET a été lancée en août 2025, et ses résultats ont été présentés au Conseil des tumeurs moléculaires afin d’orienter les patients vers un traitement ciblé en fonction des résultats de leur profilage ctDNA. Peu après, en septembre 2025, l’étude OVATION a également été lancée.

Titre

Contemporary research has uncovered a role for environmental copper in the development and progression of neurodegenerative diseases such as Alzheimer’s and Parkinson’s disease. Previous research implicated non-ceruloplasmin bound copper in the aggravation of neurodegenerative phenotypes. Our research explores the role of copper in ALS progression through monitoring of copper biomarkers and analyses of copper metabolism gene expression.

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Publications

  • A. N. Rose*‡, J. Maxwell*, E. Rousselle*, C. L. Mukonoweshuro, I. E. Elkholi, M. Riaud, M. Biondini, E. Cianfarano, I. Soria-Bretones, C. Tobin, M. McGuire,  R.W.Y. Law, A. J. Elia, B. X. Wang, I. King, T. Zhang, T. Pugh, Z. Saeed Kamil, M. O. Butler, F. A. Shepherd, N. Leighl, A. Abdul Razak, A. Hansen, S. Saibil, P. L. Bedard, P. M. Siegel, L. L. Siu, D. W. Cescon, A. Spreafico‡. Binimetinib and encorafenib for the treatment of advanced solid tumors with non-V600E BRAF mutations: results from the Phase II BEAVER trial. *Equal Contribution Co-Corresponding Authors. (2025) Nature Communications. Accepted, In Press.
    Preprint: https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2024.07.28.24311101v1
  • Labidi, B. Jiao, S. Tam, P. Fallah, A. Salehi, R. Rajan, M. Alameldine, F. Brimo, W. Foulkes, A. Papadakis, N. Kaul, A. Spatz, C. Ferrario, R. R. Saleh, A. A. N. Rose‡. Evaluating the role of liquid biopsy to detect pathogenic Homologous Recombination Repair (HRR) gene alterations in metastatic prostate cancer. Cancers 2025, 17(21), 3427. https://doi.org/10.3390/cancers17213427
  • Substudy G of the Canadian cancer trials group (CCTG) IND.234: PC_BETS (V)—A circulating tumor DNA (ctDNA)–directed phase II study of carboplatin in patients (Pts) with previously treated metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC). A. A. N. Rose, S. Hotte, E. Winquist, R. Macfarlane, K. Chi, M. Kolinsky, M. Salim, D. Jiang, M. Ong, C. Ferrario, A-K. Lalani, D.S. Ernst, P. Fallah, M. Annala, E. Kwan, F. Vera-Badillo, L. Seymour, W. Tu, A. Wyatt, M. Jafri. 2025 ASCO Annual Meeting. June 2025, Chicago, IL. https://doi.org/10.1200/JCO.2025.43.16_suppl.5058
  • Cavallone L, Aguilar-Mahecha A, Lafleur J, Brousse S, Aldamry M, Roseshter T, et al. Prognostic and predictive value of circulating tumor DNA during neoadjuvant chemotherapy for triple negative breast cancer. Scientific Reports. 2020;10(1):14704. https://www.nature.com/articles/s41598-020-71236-y
  • Aguilar A, Roseshter T, Klemantovich A, Cavallone L, Lafleur J, Lan C, et al. Circulating tumor DNA detection after neoadjuvant chemotherapy and prediction of distant relapse free survival, local recurrence, and distant recurrence in triple-negative breast cancer in the TRICIA study. Journal of Clinical Oncology. 2024;42(16_suppl):610. https://ascopubs.org/doi/10.1200/JCO.2024.42.16_suppl.610
  • Roseshter T, Klemantovich A, Lafleur J, Lan C, Cavallone L, Bozek K, et al. Clinical Validation of Digital PCR-based ctDNA detection for risk stratification in residual triple negative breast cancer: TRICIA trial results. medRxiv. doi: https://doi.org/10.1101/2025.07.02.25330747

Collaborations

Dr. Wilson Miller, Lady Davis Institute, Montreal

Dr. Sonia del Rincon, Lady Davis Institute, Montreal

Dr. Carolyn Baglole, RI-MUHC, McGill University, Montreal

Dr. Jun Ding, RI-MUHC, McGill University, Montreal

Dr. Susan Gaskin, Department of Chemical Engineering, McGill University, Montreal

Dr. Bernard Robaire, Department of Pharmacology McGill University, Montreal

Dr. Brandon Pearson, Columbia University, New York

Dr. John Wise, University of Louisville, Kentucky

Prix et récompenses

April Rose

Melica N. Brodeur

  • 2025-2029 : Chercheuse-boursière clinicienne, Junior 1 FRQS : Fonds de Recherche du Québec – Santé (FRQS)
  • 2023-2026 : Permettre une oncologie de précision dans le traitement des cancers gynécologiques rares, Marathon of Hope Cancer Centre Network, Terry Fox Research Institute

April Rose

  • 2025-2029 : Chercheuse-boursière clinicienne, Junior 2 FRQS : Fonds de Recherche du Québec – Santé (FRQS)
  • 2024-2027 : Prix pour cliniciens-chercheurs du Marathon de l’espoir ; MOHCCN, Terry Fox Research Institute
  • 2022-2025 : Prix pour le développement de carrière ; Conquer Cancer Foundation of ASCO, Alexandria, VA, USA
  • 2021-2025 : Chercheuse-boursière clinicienne, Junior 1 FRQS : Fonds de Recherche du Québec – Santé (FRQS)

Jian Qin

  • FRQS Doctoral Award, McGill University Faculty of Medicine Internal Studentship

Deanna MacNeil

  • CIHR CGS-M, CIHR Doctoral Award, Cole Foundation Studentship

Tsz Wai (Josephine) Chu 

  • FRQS Doctoral Award, McGill University Faculty of Medicine Internal Studentship
  • CIHR McGill Cancer Center Consortium/McGill Integrated Cancer Research Training Program Studentship

Johanna Mancini

  • FRQS doctoral award, Cole Foundation Studentship

Yasmin D’Souza

  • CIHR Doctoral Award

May Shawi

  • CIHR Doctoral Award, Cole Foundation Studentship

Marie Eve Brault

  • FRQS Doctoral Award, Cole Foundation Studentship

Johans Fakhoury

  • McGill University Faculty of Medicine Internal Studentship

  • CIHR McGill Cancer Center Consortium/McGill Integrated Cancer Research Training Program Studentship

Events

Dr. Wilson Miller, Lady Davis Institute, Montreal

Dr. Sonia del Rincon, Lady Davis Institute, Montreal

Dr. Carolyn Baglole, RI-MUHC, McGill University, Montreal

Dr. Jun Ding, RI-MUHC, McGill University, Montreal

Dr. Susan Gaskin, Dep’t of Chemical Engineering, McGill University, Montreal

Dr. Bernard Robaire, Dep’t of Pharmacology McGill University, Montreal

Dr. Brandon Pearson, Columbia University, New York

Dr. John Wise, University of Louisville, Kentucky

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  1. How iMALDI can improve clinical diagnostics. Popp, R., Basik, M., Spatz, A., Batist, G., Zahedi, R.P., Borchers, C.H., 2018. Analyst Clin. Chem. 64, 1271–1272. 143, 2197–2203.
  2. Immuno-MALDI-TOF-MS in the Clinic. Zahedi, R.P., Parker, C.E., Borchers, C.H., 2018.

Soutien

Le travail accompli au sein de notre consortium ne serait pas possible sans le soutien de nos bailleurs de fonds, notamment AstraZeneca, Pfizer, Teamsters Canada, Illumina et Marathon of Hope Cancer Centres Network.

Dr. Sonia del Rincon, Lady Davis Institute, Montreal

Contact

April Rose, MD, PhD, FRCPC

3755, ch. Côte Ste-Catherine 
Montréal, Québec H3T 1E2

Location: F-426

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